Агрономический факультет существует в качестве самостоятельного структурного подразделения с 1978 года. Первым деканом  был доцент Сова В.П. 

В 1979 году на базе кафедры ботаники и агрономии создаются три новые кафедры: общего земледелия; растениеводства, кормопроизводства и защиты растений; генетики, селекции и семеноводства. В этом же году создана самостоятельная кафедра химии. Первыми их заведующими  были Безруков М.В., Сова В.П., Никулин Н.Р., Василенко И.И. 

С июля 1986 года по октябрь 2006 года агрономический факультет возглавлял доктор технических наук, профессор, член-корреспондент РЭА, заслуженный работник высшей школы РФ Василенко И.И. В настоящее время обязанности декана факультета исполняет кандидат сельскохозяйственных наук, доцент Лицуков С.Д.

За время существования факультета на дневном отделении подготовлено более 1400 высококвалифицированных специалистов. Из них около 45 человек защитили кандидатские диссертации, один выпускник подготовил докторскую диссертацию.

В настоящее время в состав факультета входят шесть кафедр: земледелия и агрохимии; селекции, семеноводства и растениеводства; экологии и радиобиологии; химии, истории и философии, землеустройства и ландшафтного строительства, на которых работают 10 докторов наук, а также 41 кандидат наук, более половины из них - выпускники агрономического факультета.